技术简介
传统的蛋白质组学（包括shotgun、Label free、iTRAQ/TMT以及SILAC等）的采集模式为DDA（Data Dependent
Acquisition）。在这种模式下，质谱根据离子化的肽段母离子的强度，依次选择N个（一般10-20）强度最大的离子进入串联质谱，进行进一步碎裂，然后经过与模板蛋白质数据库比较确认。这种方法无疑丢失了大量有用的肽段母离子信息。此外，经过二级碎裂的二级谱图，在后期使用软件鉴定中也仅有少量谱图得到解析（约30%-50%），大部分谱图依然得不到有效利用。由于质谱选择离子的随机性，造成鉴定的重复度较低。又由于空间电荷效应的存在，大大限制了分析的动态范围，一些重要的低丰度蛋白得不到解析。
DIA(Data
independent acquisition) 技术融合了传统蛋白质组学“鸟枪法”(shotgun)和质谱绝对定量“金标准”选择反应监测/多反应监测（SRM/MRM）技术的优势和特点。在DIA分析中，指定质荷比（m/z）窗口内的所有肽段都经过碎裂；分析重复，直至质谱仪覆盖整个m/z范围。这实现了准确的肽段定量，而不限于分析预先定义的肽段。DIA技术具有全景式扫描、数据可回溯等优势。
技术流程
1.样品蛋白提取；
2.蛋白浓度测定；
3.蛋白酶解、肽段提取；
4.肽段校正、建库；
5.LC-MSMS串联质谱定量与定性，数据库检索；
6.结果分析、生物信息学分析；
7.提交实验结果报告。
专业品质
重复性大幅度提升，DIA的数据采集模式相比于常规非标定量DDA模式，有更少的缺失值，数据记录更为完整。
定量准确性更高，定量方式由通过一级质谱信号定量，升级为由每个肽段通过多个二级质谱峰面积信号进行定量。
实验操作简单，周期缩短，样本无需分馏分上机，极大缩短了每个样品的检测周期。
高达35,000-120,000分辨率采集，对复杂样品定性定量准确度高；
Amol (10-18
mol) 级的超高灵敏度，谱图质量高；
12-20 Hz 的超快扫描速度，同时保持 amol 级的超高灵敏度；
动态范围及线性范围达5个数量级以上。